Εργαστήριο συστηματικής γονιδιωματικής και μεταγενωμικής ανάλυσης

Σε αυτό το μονοήμερο εργαστήριο, το οποίο έχει εισαγωγικό χαρακτήρα, στοχεύουμε να εξοικειώσουμε το κοινό με τις απαιτήσεις και τις προκλήσεις της γονιδιωματικής και μεταγονιδιωματικής ανάλυσης στην πλατφόρμα Galaxy.

Η διαδικτυακή διεξαγωγή αυτού του εργαστηρίου οφείλεται στους περιορισμούς λόγω COVID-19.

Τα θέματα θα περιλαμβάνουν:

  • Εισαγωγή στη Μεταγονιδιωματική Ανάλυση - κύρια χαρακτηριστικά της πλατφόρμας ANASTASIA
  • Εισαγωγή στην πλατφόρμα GALAXY
  • Παρουσίαση των ροών εργασίας για γονιδιωματικές και μεταγονιδιωματικές αναλύσεις
  • Ροές εργασίας για συναρμολόγηση και επισημείωση γονιδιωμάτων με την πλατφόρμα ANASTASIA. Χρήση αρχείων docker για ανάπτυξη ροών εργασίας σε Galaxy-Anastasia
  • Λειτουργική ανάλυση και χαρακτηρισμός των γονιδιωμάτων και των μεταγονιδιωμάτων με το BioTranslator

Σχετικοί ιστοτόποι:

Location: 

Online (https://zoom.us/j/91673851943?pwd=dGRqd253Um9jZGQzb3FLNG5EUmZJZz09)

Institution: 

National Hellenic Research Foundation

Category: 

Basic bioinformatics courses
Scientific Software
Omics

Target Audience: 

Scientists
PhD students
Undergraduate students